Генофонд народонаселения, история его формирования и динамики изучается в двух направлениях. Во-первых, в глобальном масштабе генофонда ойкумены или, чаще, генофонда Северной Евразии. Во-вторых, проводится детальный анализ генофондов самого разного иерархического уровня, избранных в качестве модельных объектов. Каждый из модельных генофондов позволяет нам изучить роль преимущественно одного из факторов популяционной динамики. Так, изучение адыгов Северо-Западного Кавказа моделирует действие фактора иерархической подразделенности популяций, изучение Кавказа в целом - действие географических барьеров, изучение русского генофонда - факторов изоляции расстоянием и "потока генов", и так далее.